Sembilan pemberhentian di dalam dan di sekitar taman nasional, sesuai urutan yang dilalui kapal

Rute Elrora tersusun dari sembilan tempat. Kelor dan Kalong datang lebih dulu. Hari tengah milik Padar dan Pink Beach, disusul Pulau Komodo, lalu gosong pasir Taka Makassar dan terumbu terbuka Manta Point. Sebayur atau Kanawa menutup rute. Setiap tempat punya halamannya sendiri, dan isinya hanya hal yang memang dikenal luas tentang tempat itu serta apa yang dilakukan kapal di sana.

Sebagian pemberhentian adalah jalan kaki. Padar, Kelor, dan Pulau Komodo meminta sepatu yang kokoh dan sedikit waktu di darat. Sebagian lagi terumbu: Pink Beach, Taka Makassar, Manta Point, Sebayur, dan Kanawa adalah titik snorkeling, dan Elrora membawa peralatan snorkel beserta pelampung. Satu lagi cukup ditonton dari dek, yaitu Kalong saat senja.

Karena tingkat usahanya berbeda-beda, setiap halaman menyebut lama jalannya, kedalaman terumbunya, dan apa yang perlu disiapkan oleh tamu yang berjalan pelan atau belum nyaman di air. Semua pemberhentian bergantung pada cuaca, pasang surut, dan keputusan nakhoda, jadi tidak ada yang kami janjikan. Tiket taman nasional dibayar terpisah dari tarif kapal, dan halaman biaya taman memuat tarifnya.

Pada rute tiga hari, hari pertama menyinggahi Kelor, Manjarite, lalu Kalong saat senja. Hari kedua berjalan dari Padar ke Pink Beach dan Pulau Komodo, terus ke Taka Makassar dan Manta Point; pasang surut bisa menukar dua yang terakhir. Hari ketiga ditutup satu snorkeling lagi, di Sebayur atau Kanawa, dan kapal bersandar di dermaga pukul 11.00.

Rombongan private trip boleh meminta rute yang lebih panjang. Contoh empat hari menambahkan Siaba, Sebayur, dan Kanawa, sedangkan contoh dua hari melewatkan Pulau Komodo dan terumbu di hari ketiga. Rute yang lebih panjang atau privat bisa memuat pemberhentian yang tidak ada di open trip, kalau nakhoda setuju.

Tamu open trip melapor antara pukul 10.00 dan 10.30 di hari pertama, dan turun antara pukul 11.00 dan 11.30 di hari ketiga.